特别篇继续延续着第一季的故事。没有听从指挥的实习生五人组蓝泽耕作（山下智久 饰）、白石惠（新垣结衣 饰）、绯山美帆子（户田惠梨香 饰）、冴岛遥（比嘉爱末 饰）和藤川一男（浅利阳介 饰）被要求停止工作一周进行反思。这一周里，五人各进行着不一样的事情。因为上一季的意外事故，失去右手的黑田医生（柳叶敏郎 饰）则开始进行康复训练。 　　回归岗位后的五人组，遇到了列车出轨事故。列车上乘客众多，死伤惨重。实习生们和医生分批乘坐救援飞机奔赴现场。现场一片混乱，生与死的搏斗场，让实习生们只能争分夺秒。并且，灾难似乎也在慢慢靠近实习生中的一员……

特别篇继续延续着第一季的故事。没有听从指挥的实习生五人组蓝泽耕作（山下智久 饰）、白石惠（新垣结衣 饰）、绯山美帆子（户田惠梨香 饰）、冴岛遥（比嘉爱末 饰）和藤川一男（浅利阳介 饰）被要求停止工作一周进行反思。这一周里，五人各进行着不一样的事情。因为上一季的意外事故，失去右手的黑田医生（柳叶敏郎 饰）则开始进行康复训练。 　　回归岗位后的五人组，遇到了列车出轨事故。列车上乘客众多，死伤惨重。实习生们和医生分批乘坐救援飞机奔赴现场。现场一片混乱，生与死的搏斗场，让实习生们只能争分夺秒。并且，灾难似乎也在慢慢靠近实习生中的一员……

拥有直升机紧急救援的大学附属医院迎来了一批实习医生。他们分别是蓝泽耕作（山下智久 饰）、白石惠（新垣结衣 饰）、绯山美帆子（户田绘里香 饰）和滕川一男（浅利阳介 饰）。直升机每天平均运送7到8个急救患者，能协助医生坐上直升飞机是对其应变能力和医术的证明，大家都跃跃欲试。 　　四人的性格各不相同。蓝泽最有能力但过于冷静；白石理论知识很强但缺乏魄力；绯山表现欲强但易冲动；滕川则相对平庸做事马虎。最初开始的紧急救援让大家手忙脚乱，看似拉风的直升机需要与之相应的能力与魄力。在一系列救援的过程中，他们直面死亡与无奈，也鉴证奇迹，体味人情。互为竞争对手的他们，谁能最终留下来？还是携手共进？

拥有直升机紧急救援的大学附属医院迎来了一批实习医生。他们分别是蓝泽耕作（山下智久 饰）、白石惠（新垣结衣 饰）、绯山美帆子（户田绘里香 饰）和滕川一男（浅利阳介 饰）。直升机每天平均运送7到8个急救患者，能协助医生坐上直升飞机是对其应变能力和医术的证明，大家都跃跃欲试。 　　四人的性格各不相同。蓝泽最有能力但过于冷静；白石理论知识很强但缺乏魄力；绯山表现欲强但易冲动；滕川则相对平庸做事马虎。最初开始的紧急救援让大家手忙脚乱，看似拉风的直升机需要与之相应的能力与魄力。在一系列救援的过程中，他们直面死亡与无奈，也鉴证奇迹，体味人情。互为竞争对手的他们，谁能最终留下来？还是携手共进？

蓝泽耕作（山下智久 饰）离开了翔阳大学附属北部医院的急救中心，成为了一名神经外科医生。白石惠（新垣结衣 饰）依然在人手不足的急救中心担当着领导者的角色。曾经也梦想成为飞行急救医生的绯山美帆子（户田惠梨香 饰）离开翔阳医院，成为了妇产科医生。冴岛遥（比嘉爱未 饰）依然从事着飞行急救护士的工作。藤川一男（浅利阳介 饰）与白石一起留在急救中心，成为了一名整形外科的急救医生。

《紧急救命》里的菜鸟实习医生们，不再是刚来时手忙脚乱的样子，各人都有了不小的成长和变化，也加深了困惑。蓝泽（山下智久 饰）纠结于家庭；白石（新垣结衣 饰）看似变得自信，实则仍对牵连黑田医生（柳叶敏郎 饰）一事感到愧疚；绯山（户田惠梨香 饰）因为之前救援意外受伤而留下了伤疤，害怕手术；滕川（前利阳介 饰）依然是他们几个当中最一般的人；而护士冴岛（比嘉爱末 饰）则和患病的男友面对生死离别。医院方面取代黑田的是新调来的医生桔启辅（椎名桔平 饰），和黑田的风格完全不同。新的挑战接踵而来，是去是留依然是个未知数。 　　《紧急救命》第二季再开。上一季着重讲他们各自的成长，而到了第二季则更多的讲到了医患关系，经历了不少生离死别和无能为力后，成为医生的初衷是否能经受的住现实的打击，且他们对“医生”一词又有了新的认识。

为纪念《CodeBlue》剧场版7月27日上映，富士台将在7月28日播放Code Blue特别篇《Code Blue特别篇 另一个战场》，同时在23~27日晚0:25分播出五夜连续的衍生剧《Code Blue -另一个日常-》。

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朝颜、真也、长女亚美、次女里美一家四口人的生活开始了。长大的亚美有时会说一些叛逆的话，让真也有些寂寞，但充满爱的幸福日子仍在继续。就在这时，溺死的尸体被发现。虽然也发现了遗书，被认为是自杀，但解剖发现溺死有几点可疑之处，他杀的可能性浮出水面。另外，相继发现疑似触电死亡的遗体，解剖结果表明两起事件有所关联。拼命搜查的真也，与山仓和森本等重案组的成员一起，逐渐接近前方的大事件。与此同时，亚美说“感觉看到了爷爷”，开始说起不应该在附近的平的不可思议的事情…